包皮手術時，醫師會視患者之情況給予適當的麻醉，爲了避免病患對麻醉藥品的不適應而引起的嘔吐反應，手術前應禁食四至六小時；手術後，麻醉藥效消退之後，傷口會有輕微疼痛及淤腫情形，應定時服用藥物，通常在三天后，症狀即可消退，傷口在七至十天後即可痊癒。傷口癒合前，應遵照醫生要求，定期回診追蹤複查。另外，手術後傷口部分應保持清潔乾燥，小便時請小心不要弄溼紗布，如果紗布被尿液浸溼，可先將紗布拿掉，再回門診換藥。
包皮環切術是泌尿外科手術中最細小的一個，但是這個手術卻關係着男人一生的“性福”，有些患者爲了貪圖小便宜，誤信廣告上的非法宣傳，選擇各種非法小門診，小醫院做包皮手術，往往導致無法挽回的後果。新華網就曾多次報道：《男子割包皮手術失敗，命根被切僅剩一釐米》、《少年切包皮失誤致陰莖壞死》。血淋淋的悲劇面前，專家倡議：包皮小手術也要選擇層流手術室。
手術後，除了上全身麻醉的小孩爲了照顧安全上的考慮，需要短暫的住院觀察之外，一般患者仍可從事日常工作，不需住院。青春期及成年的病患在手術後會因陰莖勃起，造成傷口的腫痛出血，若是輕微出血時，只需局部冷敷加壓止血即可，若出血嚴重時，則應立即回院就診。
