導致男方不育症的主要原因是生精障礙、輸精障礙和免疫因素等。
1．精液異常 如無精子或精子數過少，活力減弱，形態異常。影響精子產生的原因有：①先天發育異常：先天性睾丸發育不全不能產生精子，雙側隱睾導致曲細精管萎縮等妨礙精子產生。②全身原因：慢性消耗性疾病，如長期營養不良、慢性中毒（吸菸、酗酒等）、精神過度緊張，可能影響精子產生。③局部因素：腮腺炎合併睾丸炎導致睾丸萎縮，睾丸結核破壞睾丸組織，精索靜脈曲張影響精子質量等。
2．精子運送受阻 附睾及輸精管炎症、結核可使輸精管阻塞而阻礙精子通過。如陽痿、早泄、射精功能紊亂、逆行射精、尿道下裂等不能使精子進入女性陰道。
3．免疫因素 精子對自身具有抗原性，但免疫屏障使機體不會對自身精於產生免疫反應：在男性生殖道免疫屏障被破壞的情況下，精子、精漿在體內產生對抗自身精子的抗體可產生男件不孕，射出的精子產生自身凝集而不能穿過宮頸黏液。
4．內分泌功能障礙 男性內分泌受下丘腦-垂體-睾丸軸功能失調。如性腺功能低下、性腺功能亢進、雄激素不敏感綜合症、高泌乳素血癥、甲狀腺功能減退、甲狀腺功能亢進等可影響精子的產生而引起不孕。
5．性功能異常 不能使精子進入女性陰道，如外生殖器發育不良、陽痿等致性交困難。
