西醫常規治療：
由於急性腎盂腎炎超過6個月未有效治療即轉變爲慢性，故應早期徹底治療;由於慢性腎盂腎炎反覆發作，致使腎臟中炎症和修復過程交替進行，結締組織增生和瘢痕形成，使得局部血運差，抗生素不易進入病竈;局部引流不暢，致病菌難以清除，因此炎症難控制，受損的腎組織不易修復。而受損腎組織在恢復之前，也是引起反覆感染的一個重要因素。因而慢性腎盂腎炎治療的重點爲儘快消滅致病菌，促使受損腎組織儘快恢復。同時積極尋找易感因素，並消除或避免，如尿路結石、畸形、前列腺增生、盆腔及外陰部的感染竈等;是抗菌治療有效的前提。抗菌治療的原則如下：
1、應針對致病菌及藥敏選擇有效藥物，應審慎篩選藥物，觀察療效。定期作尿細菌培養和菌落計數，並針對藥敏試驗的結果來選擇最敏感的抗生素。對於有尿路梗阻及感染原因(如尿路結石、膀胱頸梗阻、盆腔感染等)者，應及時排除並針對病因治療。
2、由於治病菌較爲頑固，一般抗菌藥物多采用聯合用藥方法，如SMZ+TMP，呋喃旦啶加慶大黴素，亦可選用氟哌酸、羧苄青黴素、妥布黴素、先鋒必等，療程一般爲兩週，間隔5-7天后再進行下一療程。直至尿常規及培養陰轉時爲止。有時總計療程需時2-4個月。療程一定要足夠，如不能足療程的治療，即使原治療有效果但不能徹底清除病原菌，同時也培養了耐藥菌，使致病菌得殘存，一旦條件適合，即又復發，病情遷延。因此慢性腎盂腎炎急性發作時，按急性腎盂腎炎的治療原則用藥，總療程不少於四周。當所有臨牀症狀被控制後，可停藥觀察，每月複查尿常規和尿培養，一般爲6個月左右。在抗菌療法無效時，可用抑菌療法。具體方法：每晚睡前排空膀胱後服複方新諾明2片(或呋喃旦啶0.1g;萘啶酸0.5g;氟哌酸0.2g)連續3-6個月，約60%患者尿培養可陰轉。此法費時長，應注意藥物的毒副作用。
