專家說，肛瘻大部分是由肛周膿腫引起的，肛瘻不能自愈，必須手術治療。同時肛瘻的內口處理是治療的要害所在。手術時如找不到內口，或內口處理失當，瘻管則不能完全治癒。
因此，在肛瘻手術之前，一定要仔細檢查肛瘻的內口，完全切除或切開它，才能對肛瘻進行有效治療，對內口處理的正確與嫺熟與醫生的手術經驗相關。
傳統手術採用瘻管切除術來治療肛瘻，手術的切除往往不夠徹底，容易造成手術失敗或復發。如果切除範圍過大，組織損傷較多、易引起肛門畸形、狹窄，有時將未纖維化的恥骨肌切斷，如何治療肛瘻出血要治療肛門失禁，避免給病人帶來很大痛苦。
在治療肛瘻上，肛腸專科醫院採用美國專業的肛瘻治療儀——HCPT微創術。HCPT微創術具有高頻電容場痔瘡治療功能、高頻電刀、電容場止血鉗功能。治療過程疼痛小、出血少、快速、徹底，無需住院，不影響工作，治療後複發率極低。
肛腸專科醫院專家說，這種微創無痛治療是通過直腸纖維鏡進入到肛門裏面，通過監視器，直接對內口進行微創電凝，使肛瘻的內口乾結閉合，然後洗乾淨瘻管裏面的膿液，這樣大便後，糞便裏面的細菌和糞水進不到周圍的組織裏面去，不會形成感染、疼痛。
