肝昏迷是很多晚期肝硬化患者的嚴重併發症之一，醫學上稱之爲“肝性腦病”，如果搶救不及時，治療不得當，病死率極高。對於肝昏迷是否可以選擇氨基酸治療，各家學者認識不一致，有的學者認爲可用，但有的學者又持反對意見，究竟那種觀點正確呢？
晚期肝硬化患者由於肝功受損，往往伴有嚴重營養不良、低蛋白血癥，此時用一些腸外營養藥物是有益的。但是，肝硬化患者一旦出現肝性腦病或肝性腦病前兆，各種氨基酸製劑就不能隨便使用了。肝硬化患者由於腸道菌羣失調，食慾下降，導致機體營養物質攝入、吸收減少，容易導致低蛋白血癥，使用複合氨基酸製劑可以起到補充人體必需氨基酸，糾正負氮平衡的作用，對患者是有益的。但是肝硬化一旦出現肝性腦病，證明肝臟功能已經進入了衰竭狀態，此時肝臟無能力代謝體內蛋白質分解產生的氨，就會出現高氨血癥。
正常人體內的支鏈氨基酸和芳香族氨基酸的比例是一定的，這種正常的比例維持着大腦正常的興奮和抑制，使人保持睡眠與覺醒。但是，晚期肝硬化高氨血癥患者由於氨的刺激，使機體胰島素和胰高血糖素分泌失衡，導致支鏈氨基酸減少而芳香族氨基酸增多。芳香族氨基酸進入腦組織，使5-羥酪胺、苯乙醇胺等假性神經遞質增多，從而刺激大腦產生肝昏迷。
有的複合氨基酸製劑不但包含支鏈氨基酸，還包含了更多的芳香族氨基酸，如果不加選擇地使用這種複合氨基酸製劑，會使支鏈氨基酸與芳香族氨基酸的比例更加失衡，加重患者的肝昏迷。因此，多種複合氨基酸製劑在藥品說明書中明確提示，肝性腦病或肝性腦病傾向的患者禁忌。肝性腦病患者不能盲目使用各種氨基酸製劑，而是要有選擇地使用支鏈氨基酸製劑。國內常見的支鏈氨基酸製劑有支鏈氨基酸、六合氨基酸（又名BCAA-3H注射液、肝腦清、肝醒靈、肝安注射 液）、肝安等。
