病原體爲肉芽腫莢膜桿菌，又稱爲杜諾凡菌，是不能活動的革蘭染色陰性短桿菌，無芽胞，長約0.5微米～0.7微米，組織塗片可見細菌在肉芽腫損害的單核細胞內，爲一卵圓形的小體(Donovan小體)，稱細胞載體。
腹股溝肉芽腫的西醫病因一：
此菌即在小體的空泡中繁殖，有時在多形核白細胞和榮細胞內的多個病竈中再繁殖，每個病竈含有20～30個小體，成熟後的細胞破裂釋放到組織內。電子顯微鏡觀察，與腸道細菌具有共同的噬菌體。因此，人們認爲可通過糞便污染環境來傳播，男性同性戀病人通過肛交而傳染。此菌能在受精卵的卵黃培養基上生長。
腹股溝肉芽腫的西醫病因二：
從活動性損害的邊緣取材，可見表皮由棘層肥厚到假性上皮瘤樣增生，中心區域可有萎縮和潰瘍形成，在棘層肥厚區域可見到多形核白細胞外移和小膿腫形成。在真皮上部顯示瀰漫性和高密度的細胞浸潤、水腫，豐富的脈管及毛細血管內皮增生。浸潤的細胞內含較多的漿細胞，多形核白細胞形成竈性的小膿腫，大量的組織細胞、少量的淋巴細胞浸潤。用姬姆薩染色，可見散在的大的單核吞噬細胞(組織細胞)，胞漿內呈多囊分隔空泡狀，其中有1～20個直徑1微米～2微米卵圓形小體，即杜諾凡小體。
