如有典型的生殖器皰疹症狀，結合病史，排除藥物過敏及其他感染性疾病、變態反應性疾病，診斷一般並不困難。臨牀不能肯定時，可進一步進行實驗室檢查，包括病毒分離和鑑定、細胞學檢查和血清學方法。其中病毒分離和鑑定可用於確診。現將常用實驗室檢查方法分述如下：
1、病毒分離 通常用組織培養、鑑定、分型加以證實，但分離成功的前提是取材的準確和儘快接種。必須從發病1~3天內的病損處用棉拭子從水皰底部取得標本，迅速送實驗室作組織培養和病毒分離，陽性率可達75%~85%.
2、檢測病毒包涵體 皰疹病毒感染的快速診斷可取臨牀標本在顯微鏡下尋找病毒包涵體。
3、免疫細胞化學檢查 通常用皮損細胞塗片，經特殊處理後在熒光顯微鏡下觀察檢測抗原，生殖器皰疹病毒感染細胞可見亮綠色熒光。
4、其他 如用電子顯微鏡檢查病毒顆粒等。
生殖器皰疹的治療原則
生殖器皰疹是由單純皰疹病毒引起，是慢性復發過程。目前醫療界尚無徹底治癒方法。面對生殖器皰疹患者的治療，目的在於：
(1)減輕症狀，促進皮損癒合，縮短排毒時間，減輕傳染性，縮短病程;
(2)預防減少併發症;
(3)預防復發或減少復發，無症狀或亞臨牀型生殖器皰疹無需藥物治療。有症狀者的治療包括全身治療和局部治療兩方面。全身治療的藥物主要爲開鏈烏苷衍生物，包括更昔洛韋等。
局部處理包括清潔創面和防止繼發感染。局部處理應在全身治療前提下進行，效果較佳。
