引起肌陣攣的原因很多，癲癇(包括嬰兒痙攣症)、小腦性共濟失調、低鈣血癥和一些代謝性疾病均可能出現肌陣攣。在嬰幼兒時期，由於神經系統發育尚不完善，可能出現一過性肌陣攣。正常兒童在睡眠時也可能肌陣攣，此不屬於病態。
癲癇及嬰兒痙攣症等疾病引起的肌陣攣，一般在腦電圖檢查時有癲癇性放電。嬰兒痙攣症的腦電圖檢查，表現有特徵性放電。如果肌陣攣頻繁發作，而普通腦電圖檢查正常，可以進行24小時動態腦電監護，以提高癲癇性放電檢出率。還可做視頻腦電圖檢查，以便排除假性癲癇。值得一提的是，腦電圖檢查屬於無創傷性檢查，家長不必有顧慮。
如果孩子肌陣攣發作用單用維生素B6就可，有可能是維生素B6缺乏症或維生素B6依賴症。
患肌陣攣的孩子首先要明確其病因，特別是應確定是否爲癲癇。因此孩子出現肌陣攣，應該找小兒神經專科醫師就診，如果確診爲癲癇，就應遵照醫囑進行正規抗癲癇治療。
如果確診爲維生素B6缺乏症或維生素B6依賴症，只要補充維生素B6就可以了，長期使用無明顯毒副作用。有一種情況是孩子或哺乳期婦女因爲飲食不當，導致維生素B6攝入不足，只要調整食物就可以糾正。
單憑肌陣攣發作，很難確定是否有後遺症，要視具體的病因。一般來說，癲癇治病不及時或不正規治療，可能發生腦損傷和後遺症。嬰兒痙攣症是一種特殊類型的癲癇，治療相對困難一些，只有5%～10%的孩子可以治癒。肌陣攣對孩子智力的影響也要看其病因，需要定期找醫師進行測試和評價。
