蘆筍
新鮮蘆筍富含包括維生素C在內的多種抗氧化營養素。挪威《斯堪的納維亞農業學報》刊登一項新研究發現，微波爐加熱會導致蘆筍中維生素流失。因爲維生素C和B族維生素屬於水溶性維生素，穩定性更差，遇水、遇熱、遇光容易遭到破壞。
母乳
很多媽媽將母乳擠入奶瓶存入冰箱，使用時再用微波爐加熱，這容易導致其中重要營養素減少。美國《兒科》雜誌刊登一項研究發現，微波爐加熱的母乳中含大腸桿菌的危險比其他方式加熱高18倍。
西蘭花
西蘭花是最常見的微波食物。然而，美國《食品和農業的科學雜誌》刊登一項研究發現，用微波爐烹飪西蘭花會導致其中抗氧化成分減少97%。而用燃氣竈烹飪西蘭花只會導致其中抗氧化物減少11%。
幹辣椒
幹辣椒中的辣椒素具有揮發性和不穩定性，微波加熱很容易着火。微波加熱過程中，幹辣椒散發出的化學物質會刺激眼睛和嗓子。
冷凍水果
美國《生物電磁學》雜誌刊登一項研究發現，用微波爐解凍冷凍水果容易導致有益健康的葡萄糖苷和半乳糖苷轉變爲致癌物質。冷凍水果的最好解凍方法是常溫下自然解凍。
大蒜
美國《營養學雜誌》刊登一項研究發現，微波爐加熱1分鐘就會摧毀大蒜中的活性硫烯丙基化合物，使之失去應有的抗癌作用。 北京朝陽醫院營養師宋新最後提醒，大部分的蔬菜尤其是綠葉菜如果用微波爐加熱，都有可能存在營養素流失過多的問題，因爲蔬菜中維生素C等營養素對光熱較爲敏感。而肉類、蛋類、主食類用微波加熱，營養損失較小。
微波爐只要使用正確不致癌
一些食物加熱到120℃纔會產生致癌物
不可妖魔化微波食品，事實上，微波爐和傳統的烹飪方式一樣，只不過是一種新的烹飪方式而已，因之需要辯證地認知，無需大驚小怪。
微波只是加熱食物中的水分子，它並不直接產生致癌物。如果食物加熱溫度過高，比如超過120℃，氨基酸和碳水化合物反應可能產生丙烯酰胺類疑似致癌物，比如煎炸烤制各種麪食、餅乾點心、薯條、薯片、咖啡豆等食品都會產生;超過200℃，則蛋白質可能產生雜環胺類致癌物，比如魚肉煎炸烹調的時候;超過300℃，食物中的脂肪會大量產生苯並芘類致癌物，比如肉類烹調不當發生焦煳的時候。
據瞭解，微波爐日常用來加熱剩飯剩菜，最終食物溫度只有不到100℃。微波本身就有一定的殺菌作用，60-70℃已經可以達到加熱效果，故不需要加熱到100℃以上。對於粥、湯、牛奶、米飯、麪條之類高水分食品而言，只要水分沒有被蒸乾，食物溫度會始終維持在100℃，不會出現產生致癌物的情況。
