陰道沖洗器通常在下列情況下才使用：
1、婦科沖洗：適用於女性日常沖洗清潔陰道和陰道疾病的治療，老年性陰道炎沖洗治療，以及經後產後房事前後的清洗預防生殖道傳染病，避免交叉感染。
2、減肥灌腸：中藥灌腸治療便祕、痔瘡、結腸炎、前列腺炎、女性美體美容、中老年保健，清水灌腸減肥是最安全最有效的減肥方法，現已風行歐美國家。
3、其它沖洗：嬰幼兒和老弱病殘者便後沖洗肛門、創傷、褥瘡沖洗治療等。
除了上述的情況以外，無病的儘量不要使用，以免受到不必要的細菌感染。
據美國學者提供的數據，每月接受陰道沖洗器陰道沖洗1-3次或4次以上者，其沙眼衣原體感染的危險，分別比未沖洗過的婦女高2.6倍或3.8倍。之所以會這樣，是因爲陰道沖洗破壞了致病菌與保護菌之間的平衡，使致病菌急劇生長。
