體格檢查是臨牀診斷的第一步，超聲波檢查對臨牀上在陰囊內摸不到雙側睾丸者，應首先使用超聲波作爲篩選診斷，報道其診斷率達88%。X線攝影《cT》是目前臨牀上常用的一種極爲重要的檢查方法 ，可以用來檢查任何部位的隱睾，特別在高位隱睾的診斷中有相當的價值。
隱睾的特殊檢查：
1、B型超聲波檢查是目前最常用的方法，這種檢查無損傷且可以同時檢查病人有無腎積水、畸形、結石等泌尿系統病變，對於腹股溝管內的隱睾有相當高的診斷率，但對於腹內隱睾的診斷率還不夠高。
2、電子計算機斷層掃描(CTScan)和核磁共振(MRI)近年來也用於腹內隱睾的定位診斷，均有相當高的準確性。這二種檢查的缺點是在年幼的兒童檢查比較困難而且費用很高。
3、選擇性精索內靜脈造影是一個曾經廣泛採用的方法，可從造影劑注入後的精索內靜脈末端形態來診斷隱睾的位置，或者睾丸缺如。但常常由於靜脈瓣影響了精索內靜脈顯影，而且對2歲以下的兒童操作很困難。
4、腹腔鏡近年來已廣泛的用於腹內隱睾的診斷和治療，腹腔鏡應用範圍廣泛可用於各種年齡的隱睾病人及1歲以下兒童，操作方法簡單而且時間短，隱睾診斷率可達88％至100％。可以確定隱睾的位置或者睾丸缺如，在腹腔鏡檢查中常可先在腹膜後沿睾丸血管解剖位置找睾丸血管沿精索血管可找到位於腹內或者腹股溝內環處睾丸，如果沿血管見到血管盲端可以確定是睾丸缺如。如果盲端有結節應切除並送病理檢查。
