臨牀表現
潛伏期，較流感、禽流感潛伏期長，潛伏期時長七天。
甲型H1N1流感的早期症狀與普通人流感相似，包括髮熱、咳嗽、喉痛、身體疼痛、頭痛等，有些還會出現腹瀉或嘔吐、肌肉痛或疲倦、眼睛發紅等。
部分患者病情可迅速進展，來勢兇猛、突然高熱、體溫超過39℃，甚至繼發嚴重肺炎、急性呼吸窘迫綜合症、肺出血、胸腔積液、全身血細胞減少、腎功能衰竭、敗血症、休克及Reye綜合症、呼吸衰竭及多器官損傷，導致死亡。患者原有的基礎疾病亦可加重。
診斷標準
衛生部2009年4月３０日印發的《人感染豬流感診療方案（2009版）》中指出，人感染豬流感的診斷主要結合流行病學史、臨牀表現和病原學檢查等，臨牀上早發現、早診斷是治療的關鍵。
同時，診療方案還詳細介紹了人感染豬流感的診斷標準，具體有以下四種情況：
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--臨牀診斷病例：被診斷爲疑似病例，且與其有共同暴露史的人被診斷爲確診病例者；
——疑似病例：曾到過疫區，或與病豬及豬流感患者有密切接觸史（也可流行病學史不詳），1周內出現流感臨牀表現，呼吸道分泌物、咽試子、痰液、血清Ｈ亞型病毒抗體陽性或核酸檢測陽性；
--醫學觀察病例：曾到過豬流感疫區，或與病豬及豬流感患者有密切接觸史，1周內出現流感臨牀表現者。列爲醫學觀察病例者，對其進行７天醫學觀察（根據病情可以居家或醫院隔離）；
——確診病例：從呼吸道標本或血清中分離到特定病毒；RT-PCR對上述標本檢測，有豬流感病毒RNA存在，經過測序證實，或兩次血清抗體滴度４倍升高，可確診爲人感染豬流感。
甲型H1N1作爲流感的一種，可以用傳統的中醫理論和方法進行治療，從中醫角度講，流感是感受外來邪氣，客於肺經，閉其清道，肺氣不得下降，其人必定流清涕、發熱、惡風、惡寒、頭疼身痛等情形。
法宜宣散，如桂枝湯、麻黃湯、葛根湯之類。如不能及時治療會轉爲內傷，引發腎陽衰而陰寒內生，腎絡通於肺，心肺之陽不足，不能統攝津液，而流清鼻涕，患者必定沒有外感的足徵，多睏倦無神，或噴嚏不休，或兩腳冰冷，法宜扶陽，如四逆湯、白通湯、封髓丹、麻黃附子細辛湯、薑桂湯之類。
