早期使作適當抗生素可減輕症狀，縮短病程。本病有自限性，多數病例不經治療可自愈。大環內酯類抗生素，如紅黴素，仍是肺炎支原體感染的首選藥物，成人每日劑量2g，分次服用。羅紅黴素（0.3/d，分2次服）、阿奇黴素（0.5/d，每日1次）的效果亦佳，且不良反應少。喹諾酮類如左氧氟沙星、加替沙星和莫昔沙星等，四環素類也用於肺炎支原體肺炎的治療。療程一般2-3周。因肺炎支原體無細胞壁，青黴素或頭孢菌素類等抗生素無效。對劇烈嗆咳者，應適當給予鎮咳藥。若繼發細菌感染，可根據痰病原學檢查結果，選用針對性抗生素治療。
