大部分肛瘻是由直腸肛管周圍膿腫引起的，主要症狀是肛瘻外口流出少量膿性、血性、黏液性分泌物。由於分泌物的刺激，可使肛門潮溼、瘙癢，有時可形成溼疹。當外口癒合，瘻管中有膿腫形成時，可感到明顯疼痛，同時可伴有發熱、乏力等全身症狀，膿腫破潰或切開引流後，症狀緩解。上述症狀反覆發作是肛瘻的臨牀特點。肛瘻不能自愈，如不及時治療會反覆發作直腸肛管周圍膿腫，因此必須手術治療。
肛門是人體的排泄器官，與肛門直接相接的肛管和直腸。由於此處的細菌最多，是人體最易發生感染的部位，肛管周圍的感染極易形成膿腫。膿腫經手術切開引流或自行破潰後，糞便仍可由肛管直腸壁上的原發感染竈進入膿腔，膿腔內膿液常不易引流，長期炎症刺激可使膿腔壁纖維化，不易癒合，而形瘻管。這種病理變化的結果即肛瘻的形成。有些人會覺的肛瘻就是等同於痔瘡，其實，肛瘻和痔瘡是兩種肛腸疾病。肛瘻是指肛門周圍的肉芽腫性管道，由內口、瘻管、外口三部分組成，內口常位於直腸下部或肛管，多爲一個;外口在肛周皮膚上，可爲一個或多個。
而痔瘡是指直腸下端粘膜和肛管皮膚下的直腸上、下靜脈叢擴張、迂曲而形成的團塊，當發生脫垂或出血等臨牀症狀時稱爲痔瘡。痔瘡的形成主要是因腹腔壓力增高，影響直腸和肛管的血液循環，血液迴流受阻。如大便乾結、大便次數增多、大便時間過長、久坐、腹部腫瘤、肝硬化門靜脈壓力增高、長期咳嗽、久病體虛、中氣不足、飲酒、習食辛辣燥熱食品、婦女妊娠、分娩等均可發生痔瘡。
肛瘻的診斷不困難，但要正確地尋找到瘻管的走向、瘻管的內口卻是不太容易的。因此，掌握正確的檢查方法非常重要。
①肛竇鉤檢查：以窺器伸入肛門，可見有紅腫炎症的肛竇，內口多在此處。用肛竇鉤反覆檢查肛竇，不難找到內口。探時忌用暴力，以免穿破正常肛竇，造成新的感染內口。
②探針檢查：用探針從瘻外口伸入瘻管，食指伸入肛管，多數探針可在齒線處的內口穿出。對瘻道彎曲者，探針多不能順利穿過，切忌用力過猛，使探針穿破瘻管壁，造成新的感染。
③美藍標記：將一塊適中的紗布放置於肛門內，而後將5%的亞甲藍水溶液由外口注入瘻管，然後輕輕將紗布拉出，觀察內口的位置。爾後，用窺器擴開肛門，在齒狀線附近，着色最顯着處，以肛竇鉤或探針探查，多數可發現內口。
④其他：如X線檢查、肛管壓力測定等檢查方法，較少用，有條件者也可採用。
