全身型重症肌無力患者大多適於做胸腺摘除治療，約80%無胸腺瘤的患者術後症狀可消失或完全緩解；症狀嚴重的患者一般不宜手術治療，以免增加死亡率；兒童或年齡大於65歲的患者手術指徵應個體化，儘管此手術較安全但仍要慎重。針對重症肌無力患者，目前臨牀有經胸骨切開胸腺摘除和內窺鏡下胸腺摘除術兩種胸腺摘除手術方法，各有千秋。
經胸骨切開胸腺摘除術
優點：①手術時間短；②手術操作容易。
缺點：①出血量多；②胸部創面大；③術後高度疼痛。
內窺鏡下胸腺摘除術
優點：①出血量少；②胸廓術後創面小；③術後疼痛少。
缺點：①手術時間長；②手術者操作必須熟練。
特別提示：確診胸腺瘤患者應行胸腺摘除手術，而不考慮重症肌無力的嚴重程度，早期手術治療可以降低腫瘤擴散的風險。一般情況下，兩種手術方法應是根據重症肌無力患者整體情況以及醫院技術資源來選擇。如果各方面條件成熟，一般選擇創面較小的內窺鏡下胸腺摘除術。胸腺切除術的療效常在數月或數年後顯現故該療法並非應急治療。
