抗血栓治療主要針對凝血酶和血小板兩個環節，由此分爲兩類，第一種是抗血小板藥物，用於冠心病、心腦血管疾病的患者，預防冠狀動脈和腦血管血栓的形成;還有一類藥物針對凝血酶，也就是人們常說的抗凝藥，包括肝素和華法林。
阿司匹林：具有明確的抗血小板聚集作用。雖然有些不良反應，但一般可通過保護胃腸黏膜、監測血液系統變化來避免。
氯吡格雷：是新的抗血小板聚集藥物，用於心臟支架術後，有急性冠脈綜合徵(包括急性心肌梗死和不穩定心絞痛)的患者，防止血栓形成。
其中藥物支架術後的患者通常要使用9—12個月，甚至更長時間。其優點是胃腸道刺激小，不容易出現胃腸道副作用。但缺點是價格偏貴，缺乏長年使用的經驗。多用於不能耐受阿司匹林，以及對阿司匹林耐藥的患者。而對於易形成血栓的高危患者，可以合用阿司匹林和氯吡格雷兩種藥物，但不提倡長期使用。
肝素：是最早使用的抗凝藥，可防止深靜脈血栓和肺栓塞形成，並用於急性冠脈綜合徵的患者。特點是起效快、作用直接可靠，是血栓性疾病急性發作時的首選，但也存在出血的風險，不適合長期使用。肝素又包括兩種，即普通肝素和低分子肝素。
華法林：可用於預防房顫患者的血栓形成、肺栓塞，以及深靜脈血栓。其優點是抗血栓的療效比較肯定，但是出血的風險較高，尤其是老年人，要警惕腦出血的發生，所以需要長期監測凝血功能，並在醫生的指導下隨時調整用藥的劑量。
