《名醫別錄》中載：“除膀胱邪氣，腰痛，止痢”。《藥性論》雲：“益髓，悅顏色，延年，治女人血崩，壯陽，日御過倍，大補益，主赤白下，補精敗，面黑勞傷”。《日子華本草》載：“治男子絕陽不興，女絕陰不產，潤五臟，長肌肉，暖腰膝，男子泄精，尿血，遺瀝，女子帶下，陰痛。”
《本草經疏》曰：“煮爛頓食，治老人便燥閉結。”《玉楸藥解》載“滋腎肝精血，潤腸胃結燥。”而在2000年版《中華人民共和國藥典》中記載，肉蓯蓉“補腎陽，益精血，潤暢通便。用於陽痿，不孕，腰膝痠軟，筋骨無力，腸燥便祕。”
補腎男女皆宜
補腎陽是肉蓯蓉的主要作用，在歷代補腎壯陽的藥方中，它的使用頻度最高。現代藥學研究表明，肉蓯蓉提取物能夠明顯延長陽虛動物的耐凍時間，增加因應激所致性功能低下小鼠的交配次數和射精率，還可顯着增加睾丸被切除大鼠精囊前列腺的重量。
肉蓯蓉中起補腎壯陽作用的有效成分是苯乙醇苷類成分，如松果菊苷、洋丁香酚苷等。它主要通過2種途徑起作用：其一，增強下丘腦－垂體－腎上腺功能，促進體內相關遞質和激素的釋放，提高性慾；其二，抗疲勞、提高身體機能作用。
另外，肉蓯蓉的補腎作用與其它補腎藥如淫羊藿、巴戟天等不同。其不同之處在於2點。第一，肉蓯蓉補腎而不傷陰，長期服用一般不會出現上火、口乾等症狀，故《本草綱目》謂其“補而不竣，故有從容之號”，其意爲從從容容補腎；第二，肉蓯蓉補腎男女皆宜，故其既可治療男子陽痿，也可治療女子不孕。
由於肉蓯蓉確切的補益作用，成爲歷代醫家處方中最常用的補益藥之一，被譽爲“沙漠人蔘”。
