某些部位或臟器可疑、有病變，可採用內窺鏡來檢查。內窺鏡檢查有如下優點：
①可以直接觀察到病變部位；
②可以通過內窺鏡採取活組織作病理檢查；
③通過內窺鏡作某些治療，如止血、切除息肉、取出結石等，從而起到X線檢查、同位素掃描等無法起到的作用。
常用的內窺鏡有喉鏡、支氣管鏡、食管鏡、胃鏡、十二指腸鏡、結腸鏡、腹腔鏡、膀胱鏡、陰道鏡、縱隔鏡等，分別用來檢查相應部位的病變。
由於光學技術的飛躍發展，科學家們製成了用特殊的導光玻璃纖維束製作的各種纖維內窺鏡，如纖維支氣管鏡、纖維胃鏡、纖維十二指腸鏡、纖維結腸鏡。這些纖維內窺鏡口徑小，窺視清晰，設備完善、安全，病人的痛苦較小，而且還能彎曲，使檢查的範圍進一步擴大，如纖維十二指腸鏡還可作胰膽管逆行造影檢查。因此，對診斷更有幫助。
