在月經期間，女性陰道內酸度有所降低，身體的免疫力會降低易感染病菌，經期同房會將細菌帶入陰道，引起子宮內膜炎，子宮肌炎，輸卵管炎，卵巢炎等婦科疾病，嚴重時可導致女方不孕。
月經來潮時，盆腔充血會引起腰腿痠、下腹部脹痛或不適，此時若有性生活，勢必會增加不適的感覺。女性生理期間子宮收縮會加速原來疼痛的感覺，若是此時發生性行爲，男性在女性體內射精，由於精液裏面有前列腺素，會導致子宮收縮更嚴重，比較可能產生痙攣的狀況。另外，由於此時子宮內膜剝落，經血是往下流的，發生性行爲產生撞擊會讓經血逆流，有可能產生子宮內膜異位的狀況，而且此時容易感染、發炎，所以不建議在此時發生性行爲。 同時經期同房還可能使月經分泌物進入男性尿道引起尿路感染。
