一、病原體：二者不同。肺結核是結核分枝桿菌，非典爲變異冠狀病毒(未被最終確定)。
二、傳播途徑：二者均爲呼吸道近距離飛沫空氣傳播。不同的是，非典爲病人分泌物接觸可以感染。
四、臨牀表現：二者相同點是，咳嗽、咯血痰、呼吸困難、發熱。不同點是，肺結核咳嗽時間長，多伴咯痰，進展慢，以低熱爲主，常伴有盜汗、乏力、食慾減退等症狀。粟粒型結核與結核性胸膜炎多表現爲高熱。非典多爲乾咳，以高熱爲主，常伴有全身痠痛等症狀。
五、X線檢查：二者均爲浸潤性病竈，不同點是，肺結核的陰影濃淡不均，部位多爲中上葉、粟粒結核爲瀰漫性點狀陰影。結核性胸膜炎爲反拋物線狀陰影。非典爲炎性陰影，進展較快。
六、外周血象：二者均表現爲白細胞不高或低下。不同點是，肺結核的淋巴細胞比例升高，非典的淋巴細胞減少。
七、治療：二者不同點是，肺結核有針對病原體的殺菌藥，療效好，而非典尚無針對病原體的藥物，以對症支持治療爲主。
