萎縮性胃炎可發生腸腺上皮化生和假性幽門腺化生，在增生的胃小凹和腸化上皮的基礎上可發生異型增生（dysplasia）。異型增生是一種不正常粘膜，具有不典型細胞、分化不良和粘膜結構紊亂的特點，認爲極可能是癌前病變。
一、淺表性胃炎
炎症限於胃小凹和粘膜固有層的表層。肉眼見粘膜充血，水腫，或伴有滲出物，主要見於胃竇，也可見於胃體，有時見少量糜爛及出血。鏡下見膜淺層有中性粒細胞、淋巴細胞和漿細胞浸潤，深層的腺體保持完整。此外，某些患者在胃竇部有較多的糜爛竈，或伴有數目較多的疣關凸起，稱慢性糜爛性或疣狀胃炎。
二、萎縮性胃炎
炎症深入粘膜固有膜時影響胃腺體，使之萎縮，稱萎縮性胃炎。胃粘膜層變薄，粘膜皺襞平坦或消失，可爲瀰漫性，也可呈侷限性。鏡下見胃腺體部份消失，個別者可完全消失，粘膜層、粘膜下層有淋巴細胞和漿細胞浸潤。有時粘膜萎縮可併發胃小凹上皮細胞增生，致使局部粘膜層反而變厚，稱萎縮性胃炎伴過形成。如炎症蔓延廣泛，破壞大量腺體，使整個胃體粘膜萎縮變薄，稱胃萎縮。
