患慢性淋病時淋病雙球菌沿男性尿道向後侵入後尿道的球部、膜部及前列腺部，從而引起這些部位的慢性炎症，其狀態也極不一致，通常多無特殊症狀，僅在患者抵抗力減低時（例如腹瀉、高熱、酗酒或過度疲勞等），始可產生尿道炎症狀。
排尿時有輕的尿道灼熱感、刺痛、瘙癢或尿意迫切感，有時感到前列腺區劇痛，尿道分泌物無明顯增多，只在清晨起牀時纔看到尿道口有“餬口”現象。用手指壓迫尿道深處，可見有少量稀薄粘液流出。
如壓迫會陰及前列腺區時，則壓痛顯著，並向陰莖前端、骶骨部位及睾丸等處放射。前列腺或膀胱炎症明顯時，於排尿終末往往引起痙攣性尿刺痛、末段尿液內見有血液，並出於排尿障礙等，若病變僅限於尿道，則可引起射精疼痛，血情精液或膿性精液。
