手術治療：切除腫瘤對多數患兒是第一選擇，但因腫瘤不易切除乾淨，有時顯微鏡下認爲切除已徹底，實際上殘留的腫瘤細胞是無法看到的，故手術只是完成了治療的一半。北京天壇醫院小兒神經外科病房每年做腦瘤手術200餘例，近十餘年來我們全部採用顯微手術，腦瘤的全切除率大爲提高，但遺憾的是不少患者在術前已雙目失明，腫瘤大到難以置信，雖然切除了腫瘤，但術後視力已難以恢復。我們也常看到因腦瘤開顱術後的患者，腫瘤切除很少故術後迅速復發，對第二次手術造成很大困難。
放射治療：是治療小兒腦瘤的主要手段。有的腫瘤，如生殖細胞瘤、腦幹膠質瘤等，放療可能是唯一的治療選擇。髓母細胞瘤、生殖細胞瘤不僅照射腫瘤的局部，爲了避免腫瘤的播散還要照射全腦和整個脊髓。任何切不徹底的良、惡性腫瘤進行術後放療都是有效的，只是放療對髓母細胞瘤和生殖細胞瘤有其特殊的價值。還有對顱咽管瘤的同位素內放療，有些較小的腫瘤用γ刀治療也有較好的效果。
化療：小兒腦瘤的化療目前應用較少，但對髓母細胞瘤和生殖細胞瘤採用化療效果還是相當滿意的。
中醫治療：中醫由於從整體觀念出發，實施辯證論治，既考慮了局部的治療，又採取扶正培本的方法，對於改善患者的局部症狀和全身狀況都具有重要的作用。可以彌補手術治療、放射治療、化學治療的不足。副作用小。沒有骨髓抑制方面的副作用，對消化道也不會有嚴重的影響。
