具有典型症狀的膽囊結石診斷比較容易，但由於有些膽囊結石的病人沒有什麼症狀或症狀比較輕微，沒有明顯的膽石症特點，以致在診斷方面會走一些彎路，沒有能及早發現。例如有不少膽囊結石的病人，在沒有查出膽囊結石之前，常常因爲上腹部不適、胃飽脹、噯氣及食慾不好等而被當作是胃炎、胃潰瘍或消化不良等，吃了很長一段時間治胃病的藥，但沒有什麼效果，最後找到有經驗的醫生診治，經B超檢查或口服膽囊造影而確診爲膽囊結石。診斷一明確，治療能有的放矢，自然效果也就好了。
與膽囊結石表現很相似的疾病主要有以下幾類：
(1)肝臟疾病：如病毒性肝炎、肝硬變等。
(2)胃腸道疾病：如胃腸道功能紊亂、消化性潰瘍、位置高的闌尾炎及右側結腸疾病等。
(3)膽道疾病：如膽道功能失調、膽囊腫瘤、膽囊息肉樣病變及膽道寄生蟲等。
(4)其他：如右側腎盂腎炎，帶狀皰疹及神經根炎等。
由於上述疾病容易與膽囊結石混淆不清，所以要求病人在就診時應系統地、仔細地講述自己疾病的發生及發展情況，以便給醫生的診斷提供充足的資料。同樣，作爲醫生也應全面地詢問病史，詳細地進行各種有關的檢查，並把獲得的資料進行綜合分析，儘可能及時確診。
