闌尾一端與盲腸相通，長約6～8cm，管腔狹小，僅0.5cm左右。闌尾壁有豐富的淋巴組織，這就構成闌尾極易發炎的解剖基礎。這種解剖特點，也容易使闌尾發生梗阻，約70%的病人可發現闌尾腔有不同原因的梗阻，諸如糞塊、糞石(即長時間停留的糞塊與闌尾分泌物混合凝聚，並可有鈣質等礦物質沉積而成)、食物殘塊、闌尾本身扭曲及寄生蟲(如蛔蟲和蟯蟲)等都可造成闌尾梗阻。急性闌尾炎的炎症消退後，可以在闌尾形成瘢痕性狹窄，容易導致炎症反覆發作。由於闌尾壁存在豐富的淋巴組織，炎性反應嚴重，更促使梗阻的發生。
闌尾腔內平時有大量腸道細菌存在，當有梗阻時，梗阻遠端的腔內壓力升高，闌尾壁的血循環受到影響，粘膜的損害爲細菌侵入造成條件，有時闌尾腔內的糞塊、食物殘塊、寄生蟲、異物等雖然並未造成梗阻，但能使闌尾粘膜受到機械性損傷，也便於細菌侵入。此外胃腸道功能紊亂也可使闌尾壁內的肌肉發生痙攣，影響闌尾的排空甚至影響闌尾壁的血循環，也是發炎的原因。細菌可經血循環侵入闌尾引起發炎，屬於血源性感染。
