癲癇的外科治療是針對難治性癲癇人羣，採用外科手術的方法進行治療。癲癇外科手術適應症包括：①藥物難治性癲癇，指經過正規的抗癲癇藥物治療2~3年發作仍然不能控制，每月發作次數超過2~4次;②繼發性癲癇，指腦中存在能引起癲癇發作的結構性病變（包括腦外傷後癲癇病竈、顱內炎症、腦寄生蟲、腦腫瘤、腦血管性病變、腦皮質發育不良、海馬硬化、結節性硬化等）;③特殊類型的癲癇綜合徵，如偏側抽搐—偏癱綜合徵、腦穿通畸形、一側瀰漫性皮質發育不良、Rasmussen腦炎等，除了頻繁地發作外，患者還伴有嚴重的發育遲緩，甚至有危及生命的可能，積極採取多腦葉切除或半球切除可有效挽救生命，避免更嚴重的殘障發生。
手術成功的關鍵是準確找到致癇竈（引起癲癇發作的腦皮質區或病理竈）的位置，這就需要進行手術前的綜合評估、定位。除了詳細的病史外，要做一系列的檢查，包括常規、動態、視頻腦電圖，必要時查顱內電極、頭顱CT及MRI、SPECT或PET、腦磁圖、神經心理學檢查等。對上述結果綜合評價，而不是根據某一單項的檢查結果來確定致癇竈。
外科手術的目標是切除致癇竈及阻斷癇性放電的傳播，儘可能達到發作消失。但有時是困難的，如果致癇竈在重要腦功能區不能切除，或致癇竈難以定位及多個致癇竈，通過手術達到發作消失的可能性很小，也只能對癲癇放電的傳播途徑進行阻斷而減少發作。外科手術的方式有許多種，包括致癇竈切除術、大腦半球切除術、多處軟膜下橫纖維切斷術、電凝熱灼術、腦立體定向毀損術等。手術方式的選擇需根據病人檢查定位的具體情況來確定。
可見外科治療癲癇不是一個簡單的問題，這需要具有神經內科、神經外科、神經電生理室、影像學科、PET中心、神經心理學等綜合學科的醫院才能開展。患者在選擇就醫的醫院時要考慮到這些條件。
