陰道栓劑使用不當會延誤治療，甚至使病情加重。
使用方法要正確：
使用陰道栓劑時，要洗淨雙手及會陰部（可用1/5000～1/8000的高錳酸鉀溶液清洗會陰部）;屈腿仰臥;從包裝中取出陰道栓，將其固定到輔助送入的器械上，利用器械緩緩地、儘可能深地（但不應因此而引起任何不適）將栓劑送入陰道，抽出器械，然後保持臥姿數分鐘後（最好15分鐘），方可起身。
用藥療程要充足：
使用陰道栓劑要嚴格遵照醫囑，並且治療後還應化驗陰道分泌物。經治療後即使化驗結果正常，也應在下次月經乾淨後繼續用藥一個療程。只有連續三次化驗結果均正常，才能稱痊癒。切不可因爲症狀緩解了，就虎頭蛇尾，如果不徹底治癒，病情就容易復發，還會使細菌耐藥，影響療效。
用藥後保持衛生：
要保持外陰的清潔、乾燥，防止交叉感染。患者內褲宜寬大透氣，每天更換。如果是滴蟲性陰道炎、黴菌性陰道炎等，不僅要夫妻同治，還要注意內褲每天要消毒。女性在治療期間其配偶亦應同時用藥清洗外陰，最好禁慾，如同房應使用避孕套，以防止交叉感染。有些栓劑會配有一根衛生棉條防止藥液外流，使用後要及時取出，以防止衛生棉條在陰道內放置時間過長，造成新的感染。
最好是睡前使用：
陰道栓劑宜在晚上臨睡前使用，這樣能使藥物在睡眠期間充分分解，直接作用於局部，如果白天使用，易使藥物經陰道流出，既污染內褲，又不能使藥物充分接觸病變部位。
