萎縮性胃炎疾病常見的發病原因有：
第一、慢性淺表性胃炎的繼續：慢性萎縮性胃炎可由慢性淺表性胃炎發展而來。慢性淺表性胃炎的病因均可成爲慢性萎縮性胃炎的致病與加重因素。
第二、膽汁或十二指腸液反流：由於幽門括約肌功能失調或胃空腸吻合術後，膽汁或十二指腸液可反流至胃內，並破壞胃粘膜屏障，促使H?+及胃蛋白酶反散至粘膜內引起一系列病理變化，從而導致慢性淺表性胃炎，並可發展爲慢性萎縮性胃炎。
第三、生物性因素：慢性傳染病如肝炎、結核病等對胃的影響也引起了人們的注意。慢性肝病患者常有慢性胃炎的症狀和體徵，胃粘膜染色也證實在乙肝病人胃粘膜內有乙肝病毒的抗原抗體複合物。
第四、放射：放射治療潰瘍病或其他腫瘤，可使胃粘膜損傷甚至萎縮。
第五、缺鐵性貧血：很多事實說明缺鐵性貧血與萎縮性胃炎關係密切，有些學者認爲胃炎是原發病，因爲胃炎胃酸低致鐵不能吸收，或因胃出血以致形成貧血；另一種意見認爲先有貧血，因爲身體內鐵缺乏使胃粘膜更新率受影響而容易發生炎症。
