甲型H1N1流感病毒是A型流感病毒，攜帶有H1N1甲型豬流感病毒毒株，包含有北美和歐亞豬流感、禽流感和人流感三種流感病毒的核糖核酸（RNA）基因片斷，同時擁有亞洲豬流感和非洲豬流感病毒特徵。醫學測試顯示，目前豬流抗病毒藥物達菲對這種毒株有效。美國疾控機構的照片顯示甲型H1N1流感病毒呈陰性反應。
造成1918年西班牙大流感的就是一種H1N1病毒。1918年以後，H1N1在人羣與豬羣中分別進化，可分別稱之爲人H1N1和豬H1N1。而此次新型的甲型H1N1流感病毒與豬H1N1病毒的關係最爲密切。
流感病毒有三種類型：甲型（Ａ型）流感病毒感染哺乳動物以及鳥類；乙型（Ｂ型）流感病毒只感染人類，疾病的產生通常較甲型病毒溫和；丙型（Ｃ型）流感病毒只感染人類，並不會引起嚴重的疾病。
甲型流感病毒，包括上百種不同亞型的流感病毒。對於這些亞型的不同命名，來自於H和N的不同。
所謂H和N，是指甲型流感病毒表面的兩大類蛋白質。H是紅細胞凝集素(Hemagglutinin)，其作用像一把鑰匙，幫助病毒打開宿主細胞的大門；N是神經氨酸苷酶(Neuraminidase)，能夠破壞細胞的受體，使病毒在宿主體內自由傳播。
根據H和N的形態，甲型流感病毒可由15種H型和9種N型進行排列組合，比如H1N1和H5N1等。即使是同一種亞型的流感病毒，也可能因爲基因序列的變化，在病毒的傳播性、致死率等方面出現很大差異。
