抗病毒治療是一個漫長的過程，乙肝患者最怕的就是病毒變異和耐藥，應如何應對這個難題？
核苷類藥物需要長期治療，長期治療就會出現病毒變異，病毒變異就會引發耐藥。一旦發生耐藥怎麼辦？
患者一定要跟醫生配合。一般病毒變異後，被抑制的病毒會出現小的反彈，這個時候要馬上調整治療。干擾素不會出現變異問題，因此應儘量選用干擾素，特別是年輕的病人。但是干擾素的缺點是反應比較大。
核苷類藥物要用兩年、三年甚至於更長時間，時間一長就容易出現變異，變異就要耐藥
第一，儘量選擇強效、快速的抗病毒藥，病毒被很強地抑制就不會出現變異。
第二，選擇變異率低的藥。第三，選擇毒副作用小、方便的藥物。
目前4種核苷類藥物，其療效強弱依次是恩替卡韋、替比夫定、拉米夫定、阿德福韋。耐藥率發生比較高的是拉米夫定，第一年大概20%，到第5年就升高到60%~70%，但5年以後耐藥率不再增加，所以假如拉米夫定用到5年都不耐藥，以後耐藥就很少。
替比夫定上市還不到兩年，也有一定的耐藥率。阿德福韋耐藥率比較低。目前恩替卡韋初始治療的病人5年的耐藥是1.2%，是較低的。但是假如拉米夫定耐藥了再用恩替卡韋就要增加一倍的量，而且很容易出現耐藥。拉米夫定、替比夫定、恩替卡韋3個藥物的耐藥位點是交叉的，所以一個藥出現耐藥，其他兩個藥都不太好選擇，只能選擇阿德福韋。
