肛瘻患者都有自己切身的體會與痛苦。一旦肛瘻形成，自愈的機會極少，瘻管複雜化後，常會帶來許多麻煩與一定的危害性。首先是膿水污染內褲，劇烈活動後可促使膿汁外溢，局部經常受到刺激，皮膚摩擦、痛癢，非常痛苦，影響工作和學習。其次久而久之可以使身體虛弱消瘦、精神不振、抗病能力下降，出現貧血，發作亦越加頻繁，形成互爲因果。再次由於多次反覆發作，膿液可穿破管壁順括肌間隙蔓延而形成多發性、複雜性肛瘻，不但給治療帶來了困難，而且也影響到肛門的正常生理功能。最後，肛瘻可形成直腸陰道瘻、直腸尿道瘻和直腸膀胱瘻，然及周圍臟器，最重要的是，肛瘻還有惡定傾向。
專家說，肛瘻，是臨牀上十分常見的一種肛腸病，它與痔瘡、肛裂並稱肛腸科三大常見疾病，據保守統計，中國的肛瘻患者至少要超過1000萬人，肛瘻可以發生在任何年齡，但以中青年和嬰幼兒最爲常見，男性多於女性。肛瘻是有可能發生癌變的，這已經基本得到了世界醫學界的公認。
對於肛瘻癌變的問題，用三句話可以解釋清楚：
1、肛瘻和癌沒有直接關係，肛瘻不是癌症的前期病變;
2、可能由於長期的炎症刺激或者瘢痕組織變異，慢性肛瘻確實有癌變的病例;
3、慢性肛瘻癌變的病例十分少見，肛瘻癌變的概率很低。
