作爲一種高發性肛門疾病，肛瘻的發病率僅次於痔瘡。肛瘻的危害性和痛苦程度也只有得過肛瘻的患者們纔有切身的體會：自 愈機會極少；局部經常受到刺激，皮膚摩擦、痛癢，影響工作和學習；肛瘻久之可以使身體虛弱消瘦、精神不振、抗病能力下降，出現貧血；由於多次反覆發作，膿液可穿破管壁順括肌間隙蔓延而形成多發性、複雜性肛瘻，不但給治療帶來了困難，而且也影響到肛門的正常生理功能；甚至可形成直腸陰道瘻、直腸尿道瘻和直腸膀胱瘻，然及周圍臟器。除了這些痛苦之外，肛瘻病人最關心的一個問題就是：肛瘻有沒有癌變的傾向，機率是多大？
對於肛瘻癌變機率有多大的問題，可以從以下三點解釋：
1、肛瘻和癌沒有直接關係，肛瘻不是癌症的前期病變；
2、可能由於長期的炎症刺激或者瘢痕組織變異，慢性肛瘻確實有癌變的病例；
3、慢性肛瘻癌變的病例十分少見，肛瘻癌變的概率很低。
可以說，肛瘻癌變在臨牀上是非常少見的，慢性肛瘻癌變的概率是很低的，有一種統計認爲肛瘻發生癌變是0.1%的概率，所以患者們可以不用過分緊張。 但是機率小並不代表着完全沒有。少數肛瘻患者可導致惡性病變，其導致癌變的原因主要有以下幾個方面：
1、長期的慢性炎症刺激：長期的炎症存在，使得膿性物，以及糞便從瘻管排出，從而刺激細胞異常增生，導致惡性病變。
2、細菌感染：細菌長期存在於瘻管內，特別是綠膿桿菌或結核菌感染，纏綿不愈，可導致癌變。
3、藥物刺激：長期大量地使用各種局部外用藥，經常刺激局部，導致癌變。
綜上所述，肛瘻的危害還是很明顯的，特別是反覆發作的患者，單純瘻有可能發展成複雜瘻，而且，儘管概率很低，肛瘻畢竟還是有可能惡變的。因此，肛瘻病人應早診斷、早治療、防止病久癌變。
