手足口病的臨牀表現爲發熱咽痛，在口腔、手足等部位出現丘疹或皰疹，可自愈，不留痂，多數病例經對症處理後，可在7～10天內康復，預後良好。少數病例，特別是EV71型病毒感染的患兒，可出現腦膜炎、腦炎、腦脊髓炎、肺水腫等併發症，病情兇險，可導致死亡或留有後遺症。
手足口病表現在皮膚和口腔上，但因病毒會侵犯心、腦、腎等重要器官。本病流行時要加強對患者的臨牀監測，如出現高熱、白細胞不明原因增高而查不出其他感染竈時，就要警惕暴發性心肌炎的可能。
近年發現EV71較CoxAl6所致手足口病有更多機會發生無菌性腦膜炎，其症狀呈現爲發燒、頭痛、頸部僵硬、嘔吐、易煩躁、睡眠不安穩等;身體偶爾可發現非特異性紅丘疹，甚至點狀出血點。合併有中樞神經系統症狀的人，以2歲以內患兒多見。居於以上談及的種種危害希望廣大兒童家長不可掉以輕心，應高度重視，積極預防。
