菸草中的主要成分是尼古丁，可影響藥物代謝，而多環芳香烴也是很強的肝藥酶誘導劑，可加速藥物的代謝。吸菸可影響以下藥物的療效：
解熱鎮痛藥：如撲熱息痛等，若服用後吸菸，其代謝速度加快，療效會顯著下降，僅爲不吸菸時的10％。
止痛與麻醉藥：服止痛藥後吸菸，不僅療效降低，而且其代謝產物無法迅速排出，容易積蓄中毒。此外，局部麻醉止痛藥利多卡因，會使吸菸者拔牙時的疼痛發生率增加。
抗心絞痛藥：如心痛定、阿替洛爾等，服藥後吸菸，會使藥物在血液中的濃度下降，且排泄率增加，從而影響療效。
抗精神病藥：吸菸可影響多種抗精神病藥物的代謝。據報道對90例吸菸與非吸菸精神分裂症患者進行氯氮平劑量、血藥濃度、療效等相關研究。發現吸菸者服氯氮平劑量顯著高於非吸菸者，而血藥濃度前者顯著低於後者，療效後者優於前者。故用氯氮平治療期間應禁止吸菸。
爲了保證藥物療效，服藥期間別吸菸，最好能戒菸。
鎮靜藥：
菸草中的菸鹼對中樞神經有興奮作用，可拮抗安定、利眠寧的鎮靜作用。
利尿藥：
吸菸可降低速尿等利尿藥在血液中的濃度，減弱其利尿效果。
