農藥施用後，一部分附着於植物體上，或滲入株體內殘留下來，使糧、菜、水果等受到污染;另一部分散落在土壤上(有時則是直接施於土壤中)或蒸發、散逸到空氣中，或隨雨水及農田排水流入河湖，污染水體和水生生物。農產品的殘留農藥通過飼料，污染禽畜產品。農藥殘留通過大氣、水體、土壤、食品，最終進入人體，引起各種慢性或急性病害。易造成環境污染及危害較大的農藥，主要是那些性質穩定、在環境或生物體內不易降解轉化，而又有一定毒性的品種，如滴滴涕(DDT)等持久性高殘留農藥。爲此，研究篩選高效、低毒、低殘留和高選擇性(即非廣譜的)新型農藥，已成爲當今的重要課題。
是農藥及其在自然環境中的降解產物，污染大氣、水體和土壤，破壞生態系統，引起人和動植物急性或慢性中毒的現象。農藥分有機農藥和無機農藥。污染主要由有機氯農藥、有機磷農藥和有機氮農藥等造成。造成農藥污染的原因很多，如長期使用一些禁用的高毒高殘留農藥，或在作物上濫施亂用等。
農藥污染指農藥或其有害代謝物、降解物對環境和生物產生的污染。農藥及其在自然環境中的降解產物，污染大氣、水體和土壤，會破壞生態系統，引起人和動、植物的急性或慢性中毒。
中國農業大學食品學院何繼國教授認爲，不同的蔬菜水果其清洗方法嚴格地說是不一樣的。
中國農業大學食品學院博士生導師李裏教授說，一般來說容易生蟲、生蟲後比較難防治的果蔬，常常是農藥污染比較嚴重的品種。如水果中的蘋果、梨、李子、葡萄、草莓、西瓜、橘子、香蕉等農藥殘留比較嚴重，而帶殼的水果如荔枝、龍眼等污染較小。污染較重的蔬菜有葉菜和細菜，如小白菜、青菜、雞毛菜、韭菜、菠菜、油菜等，而根菜、瓜菜和果菜(如土豆、南瓜、黃瓜、苦瓜、西紅柿、窩瓜以及洋蔥等)受到農藥的污染相對較小，並且這些蔬菜的營養成分也較高。
如何清洗蔬果
有效清洗果蔬的方法也可以減少農藥的污染。
中國農業大學食品學院何繼國教授認爲，不同的蔬菜水果其清洗方法嚴格地說是不一樣的。如清洗茄子、青椒和水果等，人們習慣用手在其表面輕輕清洗，雖然這樣可以除去部分農藥，但同時也把其表面的天然蠟質去掉了，如果這時再用水長時間地浸泡，就容易使殘留的農藥滲進蔬菜或果肉內部，所以，像茄子、蘋果、葡萄、草莓等果蔬最好用流動水沖洗，再配以專門清洗農藥的清潔劑。而葉類蔬菜，由於葉薄不方便用手清洗，其表面的蠟質就沒有被去掉，它起到了隔離的作用，農藥就不容易滲進，所以葉類蔬菜直接浸泡，就能起到減少農藥殘留的作用。
