肛裂在臨牀上往往令患者在解便的時候感到恐懼，因爲患者怕解便出血，所以便故意忍着不排，致使大便燥結，形成惡性循環。疼痛是肛裂的主要症狀。多數病人排便時即感疼痛，排便後有一短暫疼痛減輕的間隙期，隨後，出現持續且加劇的疼痛。疼痛的時間長短因肛裂的程度不同而不同，可長達數小時至整日。
其劇烈疼痛的主要原因是由於排糞時肛裂裂口內神經末梢受到刺激，立刻引起肛門內燒痛和刀割樣疼痛，從而使得肛門內括約肌痙攣收縮，導致持續性疼痛。
肛門上皮與直腸粘膜不同，伸縮性小，大便乾燥。排便時容易受刺激、被擦傷。受傷部位90%是在背側（肛門時鐘的六點位上）。肛門受傷後導致出血，出血量較小，但感覺非常疼痛，不僅在排便時感到疼痛，排便後一段時間內也會感到劇痛無比，因此也有些人從此害怕上廁所，控制排便，導致便祕，從而加重肛裂的程度。因此引起肛裂的原因中最重要的是便祕。
早期的肛裂只需要改善日常生活習慣就能治癒，但因爲是在排便通道口肛門處受傷所以排便時容易使傷口擴大。傷口也就不容易癒合了，再加上持續便祕，大便乾燥。致使最初很淺的傷口漸漸加深，傷口周圍呈堤防狀以致“潰瘍化”，這被稱做”肛門潰瘍”。發展成肛門潰瘍後，肛門變得越狹窄，導致“肛門狹窄”，肛門變得只有鉛筆粗細般狹窄，造成排便困難。這時，只有通過手術來擴大肛門。
要遠離肛裂，應防治便祕，保持大便通暢，千萬不要強行排便，養成排便的好習慣。
