番茄紅素分佈於番茄、西瓜、南瓜、李、柿、胡椒果、桃、木瓜、芒果、番石榴、葡萄、葡萄柚、紅莓、雲莓、柑桔等果實和蘿蔔、胡蘿蔔、蕪箐、甘藍等的根部。各種水果中番茄紅素含量如下：
木鱉果： 155～305毫克
西紅柿： 0.2～20毫克
番石榴： 5.23～5.50毫克（粉紅色）
番木瓜： 0.11～5.3毫克
葡萄柚： 0.35～3.36毫克（粉紅色）
胡蘿蔔： 0.65～0.78毫克
南瓜： 0.38～0.46毫克
紅薯： 0.02～0.11毫克
杏子： 0.01～0.05毫克
番茄和番茄製品中的番茄紅素，是西方膳食中類胡蘿蔔素最主要的來源，也是人體血清中含量較高的。人們從番茄中獲得的番茄紅素約佔其總攝入量的80%以上。 傳統西紅柿中的番茄紅素含量相當少，並且大量存在於西紅柿籽周圍的類脂物中，喝西紅柿汁或吃新鮮西紅柿通常意味着番茄紅素只是通過人體而很少被吸收。爲了生產具有保健及治療價值的番茄紅素營養製劑，國內外許多大的保健品公司及製藥公司，開發出含番茄紅素的軟膠囊，以利於補充人體中的番茄紅素。木鱉果中高含量的天然脂質的番茄紅素更爲寶貴！
番茄紅素廣泛存在於人體的各種器官和組織中。主要分佈在人的血液、腎上腺、肝臟、睾丸、前列腺、乳腺、卵巢、子宮、消化道等器官中，其中血液、腎上腺、肝臟、睾丸等含有較多的番茄紅素。番茄紅素具有非常優越的生理功能。其清除單線態氧的速率常數是目前常用抗氧化劑維生素E的100倍，是β—胡蘿蔔素的兩倍之多。番茄紅素是抗氧化性最強的類胡蘿蔔素。番茄紅素能有效的預防前列腺癌，對子宮癌、肺癌細胞的抑制作用顯著高於β—胡蘿蔔素、α—胡蘿蔔素。而且，人體內番茄紅素的含量與人的壽命相關。番茄紅素還具有抑制低密度脂肪蛋白的氧化和抗紫外線作用。番茄紅素是很有前途的一種功能性天然色素。
