不同乙肝病毒感染者的乙肝治療難度不同，乙肝病毒一但侵入機體會很快和肝臟正常細胞結合，並且侵入肝細胞核內，和肝細胞包成一團很難分離。所以說乙肝是很難治癒的。
乙肝難治的客觀原因
具有四十多年臨牀經驗的專家認爲無論中醫還是西醫，治療的主要目的都應該是：
1.持久抑制或清除病毒，使肝炎病變緩解，防止肝硬化乃至肝癌的發生。
2.降低或消除傳染性，即阻止肝病的蔓延。
乙肝難治的主要原因有以下幾個方面：
①病毒多處存在
乙肝病毒爲泛嗜性病毒，可在肝臟、膽管上皮細胞、胰腺、淋巴細胞等組織和細胞中存在和複製。抗病毒藥物較易清除血中的HBV（乙肝病毒），而組織細胞中的HBV則不易被清除或清除較晚，成爲復發的重要原因。
②免疫耐受
母嬰垂直傳播與嬰幼兒水平傳播爲我國HBV的主要感染特點。嬰幼兒的機體免疫系統發育與HBV感染、複製相伴隨，待免疫系統成熟後，會誤將HBV認爲是自身成分而難以發揮排斥清除反應。這是我國慢性乙肝難治療的重要原因。
③基因整合
早期感染上乙肝病毒後，由於免疫耐受，常無症狀表現，至成年期發現而開始治療時，中間往往已間隔了十餘年，乙肝病毒脫氧核糖核酸早已發生了多處基因整合。此時治療，即使血清中乙肝病毒多項指標，如“兩對半”中的e抗原等下降或消失，細胞內整合的病毒基因仍可在停藥後複製、表達，造成反跳、復發。這是造成乙肝難治的又一重要原因。
④基因變異
傳統上認爲，病毒轉陰（如“大三陽”轉爲“小三陽”）是病毒複製減弱、傳染性降低、病情好轉的標誌。但最新研究表明，即使“大三陽”轉爲“小三陽”，只要乙肝病毒脫氧核糖核酸（HBV-DNA）爲陽性，就可能預示着乙肝病毒已發生變異。這種變異說明，病毒仍復制活躍，仍有傳染性。而且e抗原（HBeAg）不能表達，表示病毒不易被清除，易致慢性化發展。更糟的是，這種變異株對抗病毒治療不敏感，表現爲複發率高、遠期療效不佳。#p#副標題#e#
乙肝難治的主觀因素
以上所講的主要是慢性乙肝難治的一些客觀因素，另外還有不少的主觀因素在很大程度上影響了療效。如：
①對象選擇不合適
許多患者不屬於抗病毒治療的範圍（如慢性病毒攜帶者、中晚期的肝硬化患者等），卻硬要使用干擾素治療，非但難以取得療效，反而容易造成不良反應。
②用藥方案不正確
一些患者雖然屬於抗病毒治療的範圍，但是所選用的抗病毒治療藥物及劑量、療程卻不正確，臨牀上也難以奏效。例如，我國乙肝患者對於α-干擾素的合適劑量應爲500萬至1000萬單位，療程爲半年至1年，但是卻很少有患者照此堅持進行。
③濫用和亂用藥物
有的患者四處求醫，今天用西藥，明天用中藥，再加上名目繁多的廣告，更讓他們無所適從。濫用藥物的結果只能增加肝臟負擔，耽誤了病情，加大了治療難度甚至加劇了病情惡化。#p#副標題#e#
正確治療肝病的方法
專家最後總結歸納了正確治療肝病的答案：配合醫生治療，注意一些禁忌，輕鬆樂觀=肝病康復。他主張治療肝病的意義是：
1.抑制病毒複製，促進病毒清除。
2.減輕肝臟炎症，改善肝臟組織，促進肝細胞修復。
3.阻止或延緩肝硬化。
4.降低HBV相關性肝癌的發生率。
5.改善患者的生活質量，延長患者的生存期。
6.延緩、解除患者的臨牀症狀。他認爲目前最有效的乙肝治療方法是抗病毒、免疫調節，是改善肝功能和阻止肝硬化，而不是刻意追求病毒陰轉。
