從大量的臨牀資料來看，多數肛瘻不會癌變，但少數患者可導致惡性病變，其導致癌變的原因有以下幾個方面：
1、藥物刺激：長期大量地使用各種局部外用藥，經常刺激局部，導致癌變。
2、細菌感染：細菌長期存在於瘻管內，特別是綠膿桿菌或結核菌感染，纏綿不愈，可導致癌變。
3、長期的慢性炎症刺激：長期的炎症存在，使得膿性物，以及糞便從瘻管排出，從而刺激細胞異常增生，導致惡性病變。
總之，肛瘻應早診斷、早治療、防止病久癌變。
