肛瘻很難自愈。在初期，肛瘻症狀是以膿腫、炎症爲主，炎症消退，瘻道逐漸形成，局部症狀逐漸減輕。但複雜性肛瘻或有急性感染時，局部有明顯的炎症反應，並伴有全身症狀。肛瘻的分類比較複雜，主要有以下幾種：
1、低位單純性肛瘻，只有一個瘻管，並通過外括約肛深部以下，內口在肛竇。
2、低位複雜性肛瘻：瘻管在外約肌深部以下，外口和瘻道有兩個以上者，內口在肛竇。
3、高位單純性肛瘻：僅有一個瘻道，瘻管穿過括約肌深部以上，內口位於肛竇。
4、高位複雜性肛瘻：有兩個以上外口，瘻管有分支，其主道通過外括約肌深部以上，有一個或兩個以上內口。
5、直腸前庭瘻：外口位於女性的前庭，內口在肛竇或直腸壁。
6、結核性肛瘻，其特徵爲發病緩慢，初起時症狀輕微，無明顯疼痛，破潰後流出清稀或白色米泔樣膿液。形成的外口不整齊，外口呈潛行性腔洞，管壁軟，肉芽多呈蒼白水腫。
7、肛瘻癌變：肛瘻久治不愈可發生癌變，瘻管軟硬，並向周圍浸潤形成較大硬結，疼痛明顯，通過病理可最後確診。
